Seuils de positivité
Lire une bille : détection, positivité, seuils spécifiques de bille, et mise à l'écart de la réactivité du receveur.
1.1 · Seuils de détection & de positivité
SAgA raisonne en deux temps, pilotés par deux seuils (tous deux configurables) :
- Le seuil de détection sépare le bruit du signal réel sur chaque bille.
- Le seuil de positivité décide ensuite si un attribut est effectivement rendu.
La règle fondamentale pour un groupe de billes
SAgA rend l'attribut commun à toutes les billes positives et absent des billes négatives. Lorsque plusieurs billes partagent le même anticorps, leurs MFI sont moyennées — mais chaque bille doit aussi passer la détection pour son propre compte.
Exemple 1 · Deux billes franchement positives → le sérogroupe
Les deux billes B44 se situent nettement au-dessus de la détection, et leur moyenne dépasse largement le seuil de positivité. SAgA rend le sérogroupe partagé B44.
Exemple 2 · Une forte, une faible → toujours le sérogroupe
Une bille est forte, l'autre seulement faiblement positive. Toutes deux passent malgré tout la détection et contribuent donc à la moyenne — et à 550, la conclusion reste B44, car la moyenne du sérogroupe absorbe la variabilité entre allèles.
Exemple 3 · Détecté, mais sous la positivité → rien n'est rendu
Ici les deux billes passent la détection, mais leur moyenne n'est que de 400 — en deçà du seuil de positivité de 500. Détecter un signal ne suffit pas à rapporter un anticorps : SAgA ne rend donc rien.
Exemple 4 · Une bille échoue à la détection → l'antigène subsiste
Le moyennage ne suffit pas — chaque bille doit aussi passer la détection. Lorsqu'une bille tombe sous le seuil de détection, elle est barrée et tous les attributs qu'elle porte sont éliminés, y compris tout sérogroupe partagé avec elle. Seul un antigène propre à la bille survivante peut encore être rendu.
1.2 · Seuils spécifiques de bille
SAgA peut appliquer une stratégie de définition du seuil de positivité d'un anticorps fondée sur des seuils spécifiques de chaque bille plutôt que sur un seuil fixe (par exemple fixé à 500 MFI). Voir Usureau et al., Eur. J. Immunol., 2024.
Les valeurs par défaut de 350 / 500 sont uniformes pour toutes les billes. SAgA peut, en option, les recalibrer bille par bille — améliorant à la fois la sensibilité et la spécificité. Vous pouvez conserver les valeurs par défaut ou activer cette option pour un contrôle plus fin, dans les deux sens, à la hausse comme à la baisse. La recalibration agit simultanément sur un seuil de détection propre à chaque bille et sur un seuil de positivité propre à chaque attribut.
Permissif · des seuils abaissés récupèrent un vrai positif faible
Certaines billes ont un bruit de fond intrinsèquement bas : une MFI inférieure à 500 peut y être déjà significative. Avec les seuils par défaut, ce signal A30 est écarté ; avec les seuils calibrés, il passe.
Strict · des seuils relevés filtrent un positif limite
Sur d'autres billes, la calibration joue en sens inverse. Pour B44, relever les seuils transforme un positif limite par défaut en absence de conclusion.
1.3 · Exclusion des anticorps anti-soi
C'est ici que le typage du patient prend toute sa valeur. Si une bille correspond à l'un des antigènes du patient lui-même, toute réactivité sur cette bille ne peut pas être un authentique anticorps anti-HLA — elle serait dirigée contre le soi. SAgA marque cette ligne comme du bruit et l'exclut du résultat anticorps et DSA — la bille ayant malgré tout été analysée par SAgA.
