enfr

Sérogroupe ou antigène

Moyenner un groupe de billes en un anticorps, ou isoler l'antigène qui porte l'excès.

Chapitre 2 — Sérogroupe ou antigène

Moyenner ou scinder

Lorsque plusieurs billes portent le même groupe sérologique, SAgA doit décider à quelle finesse rapporter l'anticorps : comme une conclusion unique au niveau du groupe, ou scindé en un anticorps spécifique d'antigène. Il compare pour cela les MFI des billes.

SituationCe que fait SAgA
MFI homogènes — valeurs proches, dans la variabilité habituelle entre billesLes moyenne en un seul anticorps de groupe sérologique.
MFI hétérogènes — une bille se détache nettement des autresScinde : un anticorps de groupe partagé par toutes les billes, plus un anticorps spécifique d'antigène portant l'excès.

« Hétérogène » dépend du nombre de billes portant le sérogroupe : avec deux billes, l'une se détachant nettement de l'autre ; avec plus de deux, au moins l'une se détachant des autres.

Homogène · moyenner en un seul anticorps de sérogroupe

Trois billes A2 aux MFI proches autour de 9000 sont moyennées en un unique anticorps A2 à 9285
Les trois billes A2 lisent 8000, 10655 et 9200 — assez proches pour relever de la variabilité entre billes. SAgA les moyenne en un unique anticorps A2 à 9285.

Hétérogène · isoler l'antigène qui porte l'excès

Une bille se détache
Trois billes A2 où A*02:03 à 12545 se détache nettement des autres
Cette fois les mêmes trois billes lisent 1677, 12545 et 2104 — l'une se détache nettement des autres. L'écart est trop important pour une simple variabilité entre billes.
Scindé en deux
SAgA scinde en un anticorps A2 large à 1890 plus un anticorps spécifique A*02:03 à 10655
SAgA scinde donc la réactivité : un anticorps A2 large à 1890 partagé par les trois billes, plus un anticorps spécifique d'antigène dirigé contre A*02:03 et portant l'excès (10655).

Plusieurs allèles, plusieurs lectures

Avec davantage d'allèles, le tableau se complexifie — par exemple A2, A*02:03 et A*02:06 tous réactifs, selon divers profils (tous homogènes ; A2 seul plus un A*02:03/06 scindé ; ou trois niveaux distincts). Là encore, c'est l'utilisateur qui décide de la stratégie : y a-t-il plusieurs anticorps, chacun spécifique d'un allèle, ou moins d'anticorps spécifiques de plusieurs allèles ? Il peut tout aussi bien s'agir d'une affinité différentielle — un anticorps unique dirigé contre les trois allèles, se fixant à chacun à un degré différent.

Le choix obéit à une règle progressive : plus l'écart entre billes est large, plus SAgA penche pour isoler un anticorps spécifique d'antigène distinct. La transition par défaut est calibrée à partir de l'expérience combinée d'experts HLA chevronnés, de sorte que le comportement de SAgA corresponde à ce qu'un expert conclurait.

Une courbe progressive reliant l'écart de MFI entre billes à la tendance à scinder
Moyennage lorsque les MFI sont proches, scission lorsque l'écart est large — une transition progressive, calibrée par des experts, plutôt qu'une coupure brutale.