Le verdict DSA
Confronter les anticorps au typage du donneur, et graduer chaque verdict.
4.4 · Le verdict DSA
Si vous fournissez le typage du donneur, SAgA compare chaque anticorps à celui-ci, colonne par colonne — l'anticorps du receveur, le typage du donneur, l'allèle du donneur (éventuellement imputé) et le verdict qui en découle. Le degré de certitude dépend de la précision du typage du donneur.
| Anticorps vs donneur | Verdict |
|---|---|
| Anti-B*44:02, donneur typé en haute résolution B*44:02 → cible exacte | DSA certain |
| Anti-B*44:02, donneur en basse résolution B44 → l'imputation prédit B*44:02 comme le plus probable, sans certitude | DSA probable |
| Anti-B*44:03, donneur en basse résolution B44 → l'imputation prédit B*44:02, mais B*44:03 reste possible, quoique moins (ou beaucoup moins) probable | DSA possible |
| Anti-B*44:02, donneur en haute résolution B*44:03 → l'anticorps ne cible pas le donneur | Pas un DSA |
| Anti-B44 de sérogroupe, donneur B*44 quel qu'il soit (haute ou basse résolution) | DSA certain |
Le niveau de l'anticorps compte aussi. Un anticorps de niveau sérogroupe cible tous les allèles de ce groupe : un anti-B44 est donc un DSA certain face à tout donneur B*44 — qu'il soit typé précisément ou non.
Tout le déroulé, en un seul endroit
- Nettoyer le signal. Des seuils adaptatifs, spécifiques de chaque bille, et une soustraction du bruit de fond locus par locus séparent le signal réel du bruit.
- Décomposer chaque MFI en son attribut propre — un sérogroupe, un sérotype, un antigène, un allèle ou un épitope.
- Déconvoluer les anticorps qui se chevauchent. Lorsque plusieurs anticorps touchent une même bille, SAgA répartit le signal entre eux — c'est sa force centrale.
- Aboutir au verdict. Un ajustement robuste mène l'analyse jusqu'au résultat de spécificité vis-à-vis du donneur.
D'un bout à l'autre, des attributs correctement définis sont la clé : ils disent à SAgA ce que chaque bille peut représenter et conditionnent chacun des anticorps rendus.
Essayer SAgA
Un site de démonstration est disponible sur demande. Écrivez à newaccount@silho.tech pour obtenir un compte, et rendez-vous sur www.silho.tech pour en savoir plus.
Vous préférez regarder ? La présentation complète est sur YouTube.
Ce manuel accompagne la vidéo de présentation SAgA ; toutes les figures sont des images extraites de cette animation.
Les cas de cette partie