Décomposition du signal
Lorsque plusieurs anticorps touchent une même bille, SAgA répartit le signal entre eux — sa force centrale.
3.1 · Alpha + bêta sur DQ
La force centrale de SAgA est de décomposer la MFI d'une seule bille en plusieurs anticorps sous-jacents. DQ en est l'exemple le plus clair : chaque molécule apparie une chaîne alpha (le gène DQA1) à une chaîne bêta (le sérogroupe DQ), si bien qu'une bille peut porter deux cibles d'anticorps à la fois.
Grâce à la règle de masquage du chapitre 1, certaines billes ne conservent qu'une seule cible, ce qui fixe son niveau : une bille ne conservant que sa cible bêta révèle la contribution bêta pure, et une bille ne conservant que sa cible alpha révèle la contribution alpha pure. La bille qui porte les deux correspond alors à leur somme.


3.2 · Un panel DQ complet
La même logique s'étend à un panel réaliste comportant plusieurs anticorps simultanés. SAgA exclut les billes négatives, retire de toutes les billes les attributs qu'elles portent, identifie chaque anticorps survivant, puis décompose chaque MFI positive en ses contributions — certaines billes portant deux anticorps à la fois.

3.3 · MFI bruitées & meilleur ajustement
Ces sommes parfaites sont le cas idéal. En pratique, un même anticorps se fixe avec des intensités légèrement différentes sur chaque bille — les MFI réelles sont bruitées, et deux billes portant le même anticorps ne s'accordent plus exactement sur son niveau.
SAgA recherche alors l'unique jeu de niveaux d'anticorps qui, ensemble, reproduit au mieux toutes les billes à la fois — un meilleur ajustement qui minimise les résidus entre les MFI observées et la somme des contributions des anticorps.
