Décomposition du signal

Lorsque plusieurs anticorps touchent une même bille, SAgA répartit le signal entre eux — sa force centrale.

Chapitre 3 — Décomposition du signal

3.1 · Alpha + bêta sur DQ

La force centrale de SAgA est de décomposer la MFI d'une seule bille en plusieurs anticorps sous-jacents. DQ en est l'exemple le plus clair : chaque molécule apparie une chaîne alpha (le gène DQA1) à une chaîne bêta (le sérogroupe DQ), si bien qu'une bille peut porter deux cibles d'anticorps à la fois.

Grâce à la règle de masquage du chapitre 1, certaines billes ne conservent qu'une seule cible, ce qui fixe son niveau : une bille ne conservant que sa cible bêta révèle la contribution bêta pure, et une bille ne conservant que sa cible alpha révèle la contribution alpha pure. La bille qui porte les deux correspond alors à leur somme.

Une bille, une MFI
La bille du haut affiche une MFI unique et non décomposée de 5000
La bille du haut lit 5000 comme valeur unique — alors qu'elle porte à la fois une cible alpha et une cible bêta.
Décomposée en deux anticorps
La bille à 5000 MFI décomposée en DQA1*02 à 2000 plus DQ2 à 3000
Ces 5000 sont la somme de ses deux cibles : 2000 pour la chaîne alpha (DQA1*02) et 3000 pour le sérogroupe bêta (DQ2). SAgA rend les deux anticorps séparément.

3.2 · Un panel DQ complet

La même logique s'étend à un panel réaliste comportant plusieurs anticorps simultanés. SAgA exclut les billes négatives, retire de toutes les billes les attributs qu'elles portent, identifie chaque anticorps survivant, puis décompose chaque MFI positive en ses contributions — certaines billes portant deux anticorps à la fois.

Un panel DQ plus large décomposé en trois anticorps
Un sérum comportant trois anticorps (anti-DQA1*02, anti-DQ2, anti-DQ7). DQ9 et DQA1*03:01 sont exclus car leur bille est négative. Chaque MFI positive se répartit ensuite entre ses contributions survivantes, et SAgA rend DQA1*02 = 2000, DQ2 = 3000 et DQ7 = 3500.

3.3 · MFI bruitées & meilleur ajustement

Ces sommes parfaites sont le cas idéal. En pratique, un même anticorps se fixe avec des intensités légèrement différentes sur chaque bille — les MFI réelles sont bruitées, et deux billes portant le même anticorps ne s'accordent plus exactement sur son niveau.

SAgA recherche alors l'unique jeu de niveaux d'anticorps qui, ensemble, reproduit au mieux toutes les billes à la fois — un meilleur ajustement qui minimise les résidus entre les MFI observées et la somme des contributions des anticorps.

Avec des MFI bruitées, SAgA trouve les niveaux d'anticorps qui reproduisent au mieux toutes les billes
Avec des entrées bruitées, SAgA rend DQA1*02, DQ2 et DQ7 à des niveaux proches des niveaux réels — la combinaison qui explique le mieux l'ensemble du panel.